Da ich Quark nicht kenne, kann ich Dir leider nicht konkret weiterhelfen, aber zumindest sagen, woran es üblicherweise liegt und wo man suchen könnte.
PostScript und PDF-Versionen älter als 1.4 kennen keine Transparenz und können sie deshalb nicht wiedergeben. Aus diesem Grund müssen die Transparenzeffekte während der Ausgabe einen Schritt vorher aufgelöst ("reduziert") werden. Es hängt also davon ab, wer diese Reduzierung beim Ausdrucken berechnet und mit welchen Einstellungen (z.B. Farbprofil, gegenüber welcher Hintergrundfarbe, sind die beteiligten Farben Schmuckfarben oder nicht, etc.) dies gemacht wird.
